У складу са Законом о територијалној организацији Републике Српске („Службени гласник Републике Српске", бр. 39/09, 70/12 и 83/14) територију Републике Српске чини 58 општина и шест градова. Градови Бања Лука, Бијељина, Добој, Приједор и Требиње у свом саставу немају општина. Подручје града Источно Сарајево чине подручја општина: Источна Илиџа, Источно Ново Сарајево, Источни Стари Град, Пале, Соколац и Трново.

Подручне јединице ван сједишта Завода врше методолошке и организационе припреме и спроводе статистичке активности за подручја на која се протеже њихова активност.

Организоване су по територијалном принципу за организовање и спровођење статистичких активности за подручје више општина.

1. Одјељење у Бањалуци за подручје градова Бањалука и Приједор као и општина: Градишка, Источни Дрвар, Језеро, Кнежево, Козарска Дубица, Костајница, Котор Варош, Крупа на Уни, Купрес, Лакташи, Мркоњић Град, Нови Град, Оштра Лука, Петровац, Прњавор, Рибник, Србац, Челинац и Шипово.

2. Одјељење у Бијељини за подручје града Бијељина и општина: Братунац, Власеница, Доњи Жабари, Зворник, Лопаре, Милићи, Осмаци, Сребреница, Угљевик и Шековићи.

3. Одјељење у Добоју за подручје града Добој и општина: Брод, Вукосавље, Дервента, Модрича, Пелагићево, Петрово, Станари, Теслић и Шамац.

4. Одјељење у Источном Сарајеву за подручје града Источно Сарајево (са његових шест општина - Источна Илиџа, Источно Ново Сарајево, Источни Стари Град, Пале, Соколац, Трново) као и општина: Вишеград, Рогатица, Рудо, Хан Пијесак.

5. Одјељење у Требињу за подручје града Требиње и општина: Билећа, Берковићи, Гацко, Источни Мостар, Љубиње и Невесиње.

6. Одјељење у Фочи за подручје општина: Калиновик, Ново Горажде, Фоча и Чајниче.